工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士，博士为他度身打造不少间谍武器。为了防止犯罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他们一起组织了一个少年侦探团，向罪犯宣战！
演员：悠木碧 水树奈奈 高垣彩阳 日笠阳子 南条爱乃 茅野爱衣 井口裕香 久野美咲 石川英郎 保志总一朗 赤羽根健治 濑户麻沙美 市道真央 爱美 市之濑加那 山路和弘 麦人 关俊彦 日高范子 草尾毅 堀江由衣 寿美菜子 石上静香 村濑迪与 井泽诗织 田泽茉纯 水濑祈
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